一直以来，都传说故事日本人的祖先是徐福，当初大秦帝国时，徐福领着3000童子东度扶桑花。在日本鹿儿岛树有“异人徐福上陆上”的标柱，还留出秦人港的地名大全；在日本富士山锦东庭园，多传说故事徐福在这里采仙丹，并繁殖子孙后代，初称秦氏，后称羽田氏这些。

《淮南衡山列传》记述徐福领着了三千童子、五谷杂粮及其大部分工匠赶到日本的平原区广泽。现在在日本也有几十座徐福庙，在福冈也有当初童子的坟墓。也有人说，日本人是韩国人的子孙后代。如今分子人类学早已解开了日本人来源于谜团。现在可以觉得这也是确实了，实锤了。

中科院上海生物科学研究所举办的《CellResearch》杂志期刊发布，日本人和在我国北方地区汉族在dna上一致。科学研究精英团队初次揭露了汉族群体可明显分为7个亚群：北方地区汉族、大西北汉族、东部地区汉族、中间汉族、南方地区汉族、东南方汉族、和广东岭南汉族。

日本人则与北方地区汉族是dna上保持一致，此外，满族人也与北方地区汉族基本上贴近，维吾尔族与北方地区和大西北汉族基本一致。维吾尔族、彝族、蒙古、广大苗族地区和壮族则拥有与众不同的群体聚类分析。

与此同时，中国人基因与西方人，东亚人，也有拉丁舞群体差别是极大，与非州群体差别较大。在酒精代谢能力看来，北方地区汉族好些于南方地区汉族，可是，从总体上，酒精代谢第一名是维吾尔族，第二名是蒙古，第三名是彝族，第四名是中间汉族，也就是河南省汉族。

酒精代谢最烂的最终两位，最后第二，福建省汉族，倒数第一广东省汉族。河南人仅仅排在中间部位。这并不意味着酒劲，反而是酒精代谢能力，酒精代谢能力弱群体，很多饮酒会引起大量病症和癌病。

日本国立大学科学博物馆等组织科学研究员工在2019年也公布，她们取得成功讲解了日本古时候绳文人的遗传物质，并推论绳文人和我国汉族有着一同先祖。日本国立大学科学博物馆带领的科学研究工作组分析绳文人尸体的dna信息内容。

发觉这种尸体的dna与中国北方汉族一致，并且，具备很强的乙醇耐受力，能融入高脂的饮食搭配日常生活。看上去应当来自于中国河南山东地区。由于，日本人沒有承继到河南东夷人的大个子dna。

依据Nonaka（2007）的数据信息，日本关东地区的男士有48%带上单倍群—D2，这些人的父系社会先祖便是绳文人。弥生时代时东北亚地区人口数量逐渐向日本海岛迁移，这批人居住在本州南边地域（现如今关西地区），因而这一部分地域的人慢慢发生较突出的东北亚地区人的特点。

这个时候新一批来源于内地的人们在弥生时代迁到日本。简易说，绳文人是石器时代进到日本的，弥生人是春秋时期进到日本的。